Há um mod exclusivo chamado que adiciona:
Com um destes sistemas, o jogador pode acessar o conteúdo do disco rígido e substituir os arquivos .xex , .bik (vídeos) e .upk (pacotes Unreal Engine 3 – o jogo roda na UE3).
Substitui todos os 12 personagens jogáveis por seus designs da G1 (Generação 1). O Optimus Prime quadrado, o Megatron que vira uma pistola (sim, eles conseguiram), e o Soundwave que vira um gravador. Isto só é possível porque o JTAG permite rodar scripts em Lua diretamente no motor Unreal.
Diferente dos jogos baseados nos filmes, War for Cybertron não se preocupa com atores humanos ou enredos da Terra. A história se passa inteiramente em Cybertron, o planeta natal dos Autobots e Decepticons, muito antes da chegada à Terra. O enredo foca na guerra civil devastadora que consumiu o planeta, mostrando a ascensão de Megatron e a tentativa desesperada de Optimus Prime de salvar seu mundo.
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